Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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