Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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TRAF2Q12933 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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TRAF2Q12933 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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TRAF2Q12933 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF2Q12933 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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