Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRJQ12913 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRJQ12913 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRJQ12913 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPRJQ12913 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
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PTPRJQ12913 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
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