Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TROQ12816 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TROQ12816 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TROQ12816 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TROQ12816 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TROQ12816 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TROQ12816 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TROQ12816 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TROQ12816 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TROQ12816 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
TROQ12816 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TROQ12816 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TROQ12816 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TROQ12816 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TROQ12816 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TROQ12816 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TROQ12816 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TROQ12816 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TROQ12816 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TROQ12816 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TROQ12816 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TROQ12816 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
TROQ12816 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TROQ12816 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
TROQ12816 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
TROQ12816 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TROQ12816 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TROQ12816 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TROQ12816 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TROQ12816 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TROQ12816 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TROQ12816 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TROQ12816 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TROQ12816 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TROQ12816 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TROQ12816 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TROQ12816 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TROQ12816 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TROQ12816 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TROQ12816 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TROQ12816 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TROQ12816 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TROQ12816 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TROQ12816 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TROQ12816 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TROQ12816 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TROQ12816 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
TROQ12816 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TROQ12816 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TROQ12816 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TROQ12816 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TROQ12816 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TROQ12816 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TROQ12816 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TROQ12816 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TROQ12816 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TROQ12816 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TROQ12816 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TROQ12816 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TROQ12816 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TROQ12816 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TROQ12816 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TROQ12816 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TROQ12816 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
TROQ12816 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TROQ12816 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TROQ12816 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TROQ12816 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TROQ12816 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TROQ12816 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TROQ12816 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TROQ12816 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TROQ12816 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TROQ12816 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TROQ12816 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TROQ12816 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TROQ12816 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TROQ12816 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TROQ12816 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TROQ12816 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TROQ12816 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TROQ12816 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TROQ12816 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TROQ12816 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
TROQ12816 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
TROQ12816 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TROQ12816 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TROQ12816 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TROQ12816 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TROQ12816 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TROQ12816 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TROQ12816 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TROQ12816 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TROQ12816 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TROQ12816 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TROQ12816 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TROQ12816 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TROQ12816 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TROQ12816 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TROQ12816 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
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