Protein–RNA interactions for Protein: Q12796

PNRC1, Proline-rich nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNRC1Q12796 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PNRC1Q12796 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNRC1Q12796 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNRC1Q12796 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNRC1Q12796 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNRC1Q12796 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNRC1Q12796 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNRC1Q12796 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNRC1Q12796 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNRC1Q12796 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNRC1Q12796 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNRC1Q12796 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNRC1Q12796 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNRC1Q12796 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNRC1Q12796 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNRC1Q12796 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNRC1Q12796 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNRC1Q12796 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNRC1Q12796 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNRC1Q12796 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNRC1Q12796 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNRC1Q12796 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNRC1Q12796 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNRC1Q12796 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNRC1Q12796 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNRC1Q12796 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms