Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 RRP42YDL111C 798 nt1.75□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 YGL069CYGL069C 465 nt1.75□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.75□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 YOL162WYOL162W 648 nt1.75□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 YIL166CYIL166C 1629 nt1.74□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 FRQ1YDR373W 573 nt1.74□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 SPC3YLR066W 555 nt1.74□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 CDC25YLR310C 4770 nt1.74□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 ISW2YOR304W 3363 nt1.73□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 RAV2YDR202C 1056 nt1.73□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 TIM9YEL020W-A 264 nt1.73□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 YGL117WYGL117W 798 nt1.73□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 OST5YGL226C-A 261 nt1.73□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 VMA10YHR039C-A 345 nt1.73□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 MRE11YMR224C 2079 nt1.73□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 HFM1YGL251C 3564 nt1.73□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 YHR097CYHR097C 1101 nt1.72□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 YEL1YBL060W 2064 nt1.72□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 RRP8YDR083W 1179 nt1.72□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 HCH1YNL281W 462 nt1.72□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 TRM112YNR046W 408 nt1.72□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 SLM4YBR077C 489 nt1.72□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 SPE1YKL184W 1401 nt1.72□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 YMR1YJR110W 2067 nt1.71□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 YER067C-AYER067C-A 324 nt1.71□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 PPE1YHR075C 1203 nt1.71□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 DFG16YOR030W 1860 nt1.7□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 TCM62YBR044C 1719 nt1.7□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 MIG2YGL209W 1149 nt1.7□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 RNA1YMR235C 1224 nt1.7□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 ENP2YGR145W 2124 nt1.7□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 BUR6YER159C 429 nt1.7□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 NDC80YIL144W 2076 nt1.69□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 STP1YDR463W 1560 nt1.69□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 NOP56YLR197W 1515 nt1.69□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 SEC15YGL233W 2733 nt1.68□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 HKR1YDR420W 5409 nt1.68□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 FMP16YDR070C 282 nt1.68□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 CBP6YBR120C 489 nt1.68□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 UTP6YDR449C 1323 nt1.68□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 SPS2YDR522C 1509 nt1.68□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 ARP10YDR106W 855 nt1.67□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 RTT105YER104W 627 nt1.67□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 RPS0BYLR048W 759 nt1.67□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 RKM1YPL208W 1752 nt1.67□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 YNL203CYNL203C 612 nt1.67□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 IST2YBR086C 2841 nt1.66□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 PET309YLR067C 2898 nt1.66□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 CIK1YMR198W 1785 nt1.66□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 SRO9YCL037C 1305 nt1.66□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 YGR237CYGR237C 2358 nt1.66□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 ARG2YJL071W 1725 nt1.66□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 ALE1YOR175C 1860 nt1.66□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 YSP1YHR155W 3687 nt1.65□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 MCT1YOR221C 1083 nt1.65□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 YBR089WYBR089W 600 nt1.65□□□□□ -2.14
TY2B-BQ12491 UBP16YPL072W 1500 nt1.65□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 PRP16YKR086W 3216 nt1.65□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 MET18YIL128W 3099 nt1.65□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 PAM16YJL104W 450 nt1.64□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 URB2YJR041C 3525 nt1.64□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 ATP25YMR098C 1839 nt1.64□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 PUF2YPR042C 3228 nt1.64□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 YDR115WYDR115W 318 nt1.64□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 SPP382YLR424W 2127 nt1.64□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 MAD1YGL086W 2250 nt1.63□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 VHR1YIL056W 1923 nt1.63□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt1.63□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 HTD2YHR067W 843 nt1.63□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 TAZ1YPR140W 1146 nt1.63□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 YGR242WYGR242W 309 nt1.62□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 MSL1YIR009W 336 nt1.62□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 YNL046WYNL046W 519 nt1.62□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 ULP2YIL031W 3105 nt1.62□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 PHO5YBR093C 1404 nt1.62□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 SCC2YDR180W 4482 nt1.62□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 GPI17YDR434W 1605 nt1.62□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 PRP18YGR006W 756 nt1.62□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.62□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 SVS1YPL163C 783 nt1.62□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 HAL1YPR005C 885 nt1.62□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 RIX1YHR197W 2292 nt1.61□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 GAS2YLR343W 1668 nt1.61□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 MYO2YOR326W 4725 nt1.61□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 YJL070CYJL070C 2667 nt1.61□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 IRC6YFR043C 714 nt1.61□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 RLP24YLR009W 600 nt1.6□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 YPR078CYPR078C 1119 nt1.6□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 RLF2YPR018W 1821 nt1.6□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt1.59□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 FMC1YIL098C 468 nt1.59□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 ATX2YOR079C 942 nt1.59□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 YPL071CYPL071C 471 nt1.59□□□□□ -2.15
TY2B-BQ12491 UTP25YIL091C 2166 nt1.59□□□□□ -2.16
TY2B-BQ12491 YLR366WYLR366W 306 nt1.59□□□□□ -2.16
TY2B-BQ12491 PTC5YOR090C 1719 nt1.59□□□□□ -2.16
TY2B-BQ12491 VMR1YHL035C 4779 nt1.59□□□□□ -2.16
TY2B-BQ12491 YPK3YBR028C 1578 nt1.58□□□□□ -2.16
TY2B-BQ12491 PRP3YDR473C 1410 nt1.58□□□□□ -2.16
TY2B-BQ12491 PGD1YGL025C 1194 nt1.58□□□□□ -2.16
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