Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 PRM1YNL279W 1986 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 VID30YGL227W 2877 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 SYF1YDR416W 2580 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 SPC72YAL047C 1869 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 APC5YOR249C 2058 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 YDR015CYDR015C 240 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 YGL042CYGL042C 306 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 NOP19YGR251W 591 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 YHL018WYHL018W 363 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 YAR070CYAR070C 300 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 HEM4YOR278W 828 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 RPL21BYPL079W 483 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 BLM10YFL007W 6432 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 KAP114YGL241W 3015 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 NOP6YDL213C 678 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 YFR056CYFR056C 369 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 YGR242WYGR242W 309 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 NSG1YHR133C 876 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 PRE8YML092C 753 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 YBL073WYBL073W 312 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 YPL238CYPL238C 390 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 SLM6YBR266C 453 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 CRT10YOL063C 2874 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 KIP2YPL155C 2121 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 ASI1YMR119W 1875 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 KEX1YGL203C 2190 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 YFH1YDL120W 525 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 OST6YML019W 999 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 YPL080CYPL080C 327 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 OSW2YLR054C 2175 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 YER158CYER158C 1722 nt4.46□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 SWC3YAL011W 1878 nt4.46□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt4.46□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 RPL40AYIL148W 387 nt4.46□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 TMA10YLR327C 261 nt4.46□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 GLN4YOR168W 2430 nt4.46□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 SHE10YGL228W 1734 nt4.46□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 IRC3YDR332W 2070 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 HCS1YKL017C 2052 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 PEX6YNL329C 3093 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 CAX4YGR036C 720 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 SGN1YIR001C 753 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 RPS4AYJR145C 786 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 YDL180WYDL180W 1644 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 TIF4631YGR162W 2859 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 MCD1YDL003W 1701 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 BNA4YBL098W 1383 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 NDC1YML031W 1968 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 KAR2YJL034W 2049 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 KIN82YCR091W 2163 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 AFT1YGL071W 2073 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 PDR10YOR328W 4695 nt4.43□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt4.43□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 RPS21BYJL136C 264 nt4.43□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 MIM2YLR099W-A 264 nt4.43□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt4.43□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 UBC4YBR082C 447 nt4.43□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 PRR1YKL116C 1557 nt4.43□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 SEC6YIL068C 2418 nt4.43□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 CBP2YHL038C 1893 nt4.43□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 VAC14YLR386W 2643 nt4.42□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 YKL100CYKL100C 1764 nt4.42□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 MDM30YLR368W 1797 nt4.42□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 YJL016WYJL016W 1686 nt4.42□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 GLT1YDL171C 6438 nt4.42□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 PSY1YKL076C 384 nt4.42□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 TAR1YLR154W-C 375 nt4.42□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 YLR346CYLR346C 306 nt4.42□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 FRE4YNR060W 2160 nt4.42□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 ULP1YPL020C 1866 nt4.42□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 SNF3YDL194W 2655 nt4.42□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 ATP22YDR350C 2055 nt4.42□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 RKM1YPL208W 1752 nt4.42□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 STN1YDR082W 1485 nt4.42□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 VPS73YGL104C 1461 nt4.42□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 STB2YMR053C 2553 nt4.42□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 MSH4YFL003C 2637 nt4.42□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 HPC2YBR215W 1878 nt4.41□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 ROT2YBR229C 2865 nt4.41□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 YJR030CYJR030C 2238 nt4.41□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 OAF3YKR064W 2592 nt4.41□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 SIN4YNL236W 2925 nt4.41□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 OAF1YAL051W 3144 nt4.41□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 YDR442WYDR442W 393 nt4.41□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 IRC4YDR540C 540 nt4.41□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt4.41□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 GTT2YLL060C 702 nt4.41□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 YML057C-AYML057C-A 390 nt4.41□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 YBL112CYBL112C 318 nt4.41□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt4.41□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 SCW11YGL028C 1629 nt4.41□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 LCB4YOR171C 1875 nt4.41□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 FUS1YCL027W 1539 nt4.41□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 ISW2YOR304W 3363 nt4.4□□□□□ -1.7
TY1A-DR3Q12441 MSH1YHR120W 2880 nt4.4□□□□□ -1.7
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