Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CPSF1Q10570 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
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