Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms