Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms