Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLEQ07864 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLEQ07864 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLEQ07864 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLEQ07864 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLEQ07864 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLEQ07864 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLEQ07864 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLEQ07864 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLEQ07864 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLEQ07864 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLEQ07864 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLEQ07864 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLEQ07864 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLEQ07864 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLEQ07864 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLEQ07864 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLEQ07864 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLEQ07864 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLEQ07864 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLEQ07864 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLEQ07864 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLEQ07864 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLEQ07864 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLEQ07864 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLEQ07864 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLEQ07864 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLEQ07864 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLEQ07864 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
POLEQ07864 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLEQ07864 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLEQ07864 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLEQ07864 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLEQ07864 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLEQ07864 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLEQ07864 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLEQ07864 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLEQ07864 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLEQ07864 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLEQ07864 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLEQ07864 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLEQ07864 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLEQ07864 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLEQ07864 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLEQ07864 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLEQ07864 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLEQ07864 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLEQ07864 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLEQ07864 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLEQ07864 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLEQ07864 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLEQ07864 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLEQ07864 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLEQ07864 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLEQ07864 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLEQ07864 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLEQ07864 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLEQ07864 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLEQ07864 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLEQ07864 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLEQ07864 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLEQ07864 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLEQ07864 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLEQ07864 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLEQ07864 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLEQ07864 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLEQ07864 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLEQ07864 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLEQ07864 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLEQ07864 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLEQ07864 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLEQ07864 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLEQ07864 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLEQ07864 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLEQ07864 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLEQ07864 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLEQ07864 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLEQ07864 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLEQ07864 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POLEQ07864 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLEQ07864 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLEQ07864 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLEQ07864 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLEQ07864 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLEQ07864 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLEQ07864 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLEQ07864 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLEQ07864 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLEQ07864 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLEQ07864 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLEQ07864 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLEQ07864 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLEQ07864 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLEQ07864 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLEQ07864 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLEQ07864 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLEQ07864 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLEQ07864 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLEQ07864 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLEQ07864 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms