Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4BQ07343 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms