Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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