Protein–RNA interactions for Protein: Q04864

REL, Proto-oncogene c-Rel, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELQ04864 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELQ04864 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELQ04864 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELQ04864 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELQ04864 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELQ04864 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELQ04864 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELQ04864 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELQ04864 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELQ04864 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELQ04864 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELQ04864 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELQ04864 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELQ04864 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELQ04864 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELQ04864 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELQ04864 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELQ04864 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELQ04864 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELQ04864 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELQ04864 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELQ04864 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELQ04864 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELQ04864 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELQ04864 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELQ04864 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELQ04864 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELQ04864 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELQ04864 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELQ04864 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELQ04864 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELQ04864 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELQ04864 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELQ04864 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELQ04864 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELQ04864 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELQ04864 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELQ04864 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELQ04864 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELQ04864 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELQ04864 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RELQ04864 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RELQ04864 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RELQ04864 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RELQ04864 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RELQ04864 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RELQ04864 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RELQ04864 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RELQ04864 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RELQ04864 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RELQ04864 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RELQ04864 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RELQ04864 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RELQ04864 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RELQ04864 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RELQ04864 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RELQ04864 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RELQ04864 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RELQ04864 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RELQ04864 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RELQ04864 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RELQ04864 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RELQ04864 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RELQ04864 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RELQ04864 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RELQ04864 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RELQ04864 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RELQ04864 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RELQ04864 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RELQ04864 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RELQ04864 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RELQ04864 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RELQ04864 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RELQ04864 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RELQ04864 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RELQ04864 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RELQ04864 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RELQ04864 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RELQ04864 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RELQ04864 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RELQ04864 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RELQ04864 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RELQ04864 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RELQ04864 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RELQ04864 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RELQ04864 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RELQ04864 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RELQ04864 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RELQ04864 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RELQ04864 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RELQ04864 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RELQ04864 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RELQ04864 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
RELQ04864 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RELQ04864 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RELQ04864 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RELQ04864 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RELQ04864 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RELQ04864 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RELQ04864 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms