Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNC4Q03721 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNC4Q03721 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNC4Q03721 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNC4Q03721 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNC4Q03721 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNC4Q03721 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNC4Q03721 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNC4Q03721 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNC4Q03721 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNC4Q03721 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNC4Q03721 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNC4Q03721 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNC4Q03721 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNC4Q03721 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms