Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms