Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNFRSF17Q02223 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms