Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms