Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms