Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms