Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDLBPQ00341 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms