Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMF1P82094 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMF1P82094 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMF1P82094 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMF1P82094 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMF1P82094 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMF1P82094 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMF1P82094 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMF1P82094 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMF1P82094 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMF1P82094 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMF1P82094 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMF1P82094 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMF1P82094 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMF1P82094 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMF1P82094 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMF1P82094 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMF1P82094 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMF1P82094 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMF1P82094 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMF1P82094 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TMF1P82094 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMF1P82094 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMF1P82094 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMF1P82094 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMF1P82094 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMF1P82094 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMF1P82094 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMF1P82094 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMF1P82094 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMF1P82094 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMF1P82094 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMF1P82094 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMF1P82094 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TMF1P82094 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TMF1P82094 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TMF1P82094 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TMF1P82094 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMF1P82094 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TMF1P82094 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TMF1P82094 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMF1P82094 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMF1P82094 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMF1P82094 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMF1P82094 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TMF1P82094 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMF1P82094 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMF1P82094 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMF1P82094 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMF1P82094 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMF1P82094 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TMF1P82094 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMF1P82094 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMF1P82094 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMF1P82094 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMF1P82094 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMF1P82094 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMF1P82094 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMF1P82094 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMF1P82094 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMF1P82094 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMF1P82094 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMF1P82094 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMF1P82094 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMF1P82094 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMF1P82094 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMF1P82094 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMF1P82094 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMF1P82094 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TMF1P82094 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMF1P82094 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMF1P82094 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMF1P82094 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMF1P82094 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMF1P82094 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMF1P82094 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMF1P82094 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMF1P82094 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMF1P82094 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TMF1P82094 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TMF1P82094 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMF1P82094 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMF1P82094 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TMF1P82094 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMF1P82094 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMF1P82094 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMF1P82094 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMF1P82094 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMF1P82094 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMF1P82094 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TMF1P82094 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMF1P82094 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMF1P82094 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMF1P82094 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMF1P82094 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMF1P82094 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMF1P82094 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMF1P82094 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMF1P82094 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMF1P82094 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms