Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOMO3P69849 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms