Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P63121 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms