Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBA52P62987 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBA52P62987 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBA52P62987 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBA52P62987 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBA52P62987 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBA52P62987 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBA52P62987 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBA52P62987 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBA52P62987 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBA52P62987 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBA52P62987 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBA52P62987 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBA52P62987 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBA52P62987 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBA52P62987 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBA52P62987 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBA52P62987 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBA52P62987 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBA52P62987 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBA52P62987 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBA52P62987 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBA52P62987 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBA52P62987 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBA52P62987 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBA52P62987 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBA52P62987 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBA52P62987 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBA52P62987 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBA52P62987 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBA52P62987 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBA52P62987 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBA52P62987 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBA52P62987 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBA52P62987 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBA52P62987 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBA52P62987 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBA52P62987 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBA52P62987 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBA52P62987 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBA52P62987 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBA52P62987 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBA52P62987 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBA52P62987 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBA52P62987 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBA52P62987 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBA52P62987 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBA52P62987 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBA52P62987 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBA52P62987 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBA52P62987 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBA52P62987 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBA52P62987 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBA52P62987 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBA52P62987 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBA52P62987 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBA52P62987 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBA52P62987 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBA52P62987 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBA52P62987 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBA52P62987 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBA52P62987 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBA52P62987 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBA52P62987 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBA52P62987 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBA52P62987 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBA52P62987 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBA52P62987 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBA52P62987 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBA52P62987 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBA52P62987 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBA52P62987 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBA52P62987 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBA52P62987 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBA52P62987 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBA52P62987 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBA52P62987 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBA52P62987 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBA52P62987 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBA52P62987 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBA52P62987 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UBA52P62987 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBA52P62987 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBA52P62987 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBA52P62987 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBA52P62987 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBA52P62987 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBA52P62987 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBA52P62987 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBA52P62987 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBA52P62987 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBA52P62987 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBA52P62987 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBA52P62987 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBA52P62987 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBA52P62987 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBA52P62987 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBA52P62987 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBA52P62987 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBA52P62987 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms