Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPD2P62316 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNRPD2P62316 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNRPD2P62316 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNRPD2P62316 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPD2P62316 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms