Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS29P62273 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS29P62273 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS29P62273 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS29P62273 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS29P62273 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS29P62273 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS29P62273 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS29P62273 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS29P62273 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS29P62273 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS29P62273 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS29P62273 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS29P62273 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS29P62273 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS29P62273 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS29P62273 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS29P62273 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS29P62273 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS29P62273 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS29P62273 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS29P62273 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS29P62273 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS29P62273 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS29P62273 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS29P62273 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS29P62273 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS29P62273 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS29P62273 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS29P62273 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS29P62273 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS29P62273 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS29P62273 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS29P62273 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS29P62273 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS29P62273 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS29P62273 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS29P62273 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS29P62273 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS29P62273 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS29P62273 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS29P62273 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS29P62273 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS29P62273 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS29P62273 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS29P62273 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS29P62273 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RPS29P62273 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS29P62273 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS29P62273 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS29P62273 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS29P62273 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS29P62273 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS29P62273 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS29P62273 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS29P62273 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS29P62273 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS29P62273 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS29P62273 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS29P62273 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS29P62273 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS29P62273 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS29P62273 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS29P62273 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS29P62273 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS29P62273 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS29P62273 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS29P62273 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS29P62273 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS29P62273 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS29P62273 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS29P62273 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS29P62273 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS29P62273 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS29P62273 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS29P62273 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS29P62273 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS29P62273 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS29P62273 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS29P62273 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS29P62273 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS29P62273 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS29P62273 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS29P62273 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS29P62273 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS29P62273 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS29P62273 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS29P62273 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS29P62273 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS29P62273 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS29P62273 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS29P62273 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS29P62273 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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