Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2NP61088 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms