Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EIF4A1P60842 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EIF4A1P60842 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EIF4A1P60842 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EIF4A1P60842 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EIF4A1P60842 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
EIF4A1P60842 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EIF4A1P60842 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EIF4A1P60842 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF4A1P60842 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF4A1P60842 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF4A1P60842 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF4A1P60842 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF4A1P60842 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF4A1P60842 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF4A1P60842 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF4A1P60842 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF4A1P60842 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF4A1P60842 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF4A1P60842 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF4A1P60842 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF4A1P60842 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF4A1P60842 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF4A1P60842 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF4A1P60842 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF4A1P60842 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF4A1P60842 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF4A1P60842 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF4A1P60842 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms