Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTBP60709 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTBP60709 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTBP60709 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTBP60709 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTBP60709 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTBP60709 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTBP60709 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTBP60709 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTBP60709 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTBP60709 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTBP60709 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTBP60709 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTBP60709 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTBP60709 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTBP60709 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTBP60709 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTBP60709 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTBP60709 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTBP60709 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTBP60709 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTBP60709 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTBP60709 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTBP60709 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTBP60709 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTBP60709 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTBP60709 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTBP60709 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTBP60709 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTBP60709 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTBP60709 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTBP60709 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTBP60709 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTBP60709 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTBP60709 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTBP60709 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTBP60709 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTBP60709 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTBP60709 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTBP60709 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTBP60709 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTBP60709 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTBP60709 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTBP60709 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTBP60709 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTBP60709 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTBP60709 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTBP60709 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTBP60709 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTBP60709 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTBP60709 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTBP60709 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTBP60709 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTBP60709 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTBP60709 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTBP60709 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTBP60709 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTBP60709 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTBP60709 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTBP60709 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTBP60709 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTBP60709 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTBP60709 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTBP60709 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTBP60709 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTBP60709 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTBP60709 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTBP60709 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTBP60709 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTBP60709 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTBP60709 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTBP60709 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTBP60709 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTBP60709 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTBP60709 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTBP60709 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTBP60709 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTBP60709 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTBP60709 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTBP60709 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTBP60709 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTBP60709 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTBP60709 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTBP60709 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTBP60709 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTBP60709 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTBP60709 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTBP60709 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTBP60709 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTBP60709 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTBP60709 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTBP60709 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTBP60709 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTBP60709 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTBP60709 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTBP60709 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTBP60709 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTBP60709 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTBP60709 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTBP60709 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms