Protein–RNA interactions for Protein: P59036

LINC00310, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00310, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00310P59036 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms