Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC01547P58512 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC01547P58512 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC01547P58512 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC01547P58512 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC01547P58512 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC01547P58512 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC01547P58512 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC01547P58512 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC01547P58512 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC01547P58512 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC01547P58512 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC01547P58512 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC01547P58512 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC01547P58512 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC01547P58512 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC01547P58512 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC01547P58512 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC01547P58512 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms