Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIK1P57059 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIK1P57059 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIK1P57059 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIK1P57059 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIK1P57059 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIK1P57059 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIK1P57059 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SIK1P57059 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SIK1P57059 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SIK1P57059 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SIK1P57059 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SIK1P57059 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SIK1P57059 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIK1P57059 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIK1P57059 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIK1P57059 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIK1P57059 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIK1P57059 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIK1P57059 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIK1P57059 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIK1P57059 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIK1P57059 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SIK1P57059 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIK1P57059 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIK1P57059 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIK1P57059 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIK1P57059 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIK1P57059 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIK1P57059 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SIK1P57059 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIK1P57059 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIK1P57059 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SIK1P57059 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIK1P57059 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIK1P57059 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIK1P57059 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIK1P57059 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIK1P57059 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIK1P57059 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIK1P57059 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIK1P57059 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIK1P57059 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIK1P57059 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIK1P57059 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIK1P57059 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIK1P57059 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIK1P57059 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIK1P57059 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIK1P57059 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIK1P57059 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIK1P57059 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIK1P57059 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIK1P57059 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIK1P57059 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIK1P57059 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIK1P57059 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIK1P57059 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIK1P57059 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIK1P57059 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIK1P57059 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIK1P57059 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIK1P57059 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIK1P57059 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIK1P57059 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIK1P57059 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIK1P57059 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIK1P57059 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIK1P57059 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIK1P57059 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIK1P57059 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIK1P57059 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIK1P57059 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIK1P57059 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SIK1P57059 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIK1P57059 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIK1P57059 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIK1P57059 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIK1P57059 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SIK1P57059 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIK1P57059 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIK1P57059 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIK1P57059 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIK1P57059 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIK1P57059 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIK1P57059 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIK1P57059 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SIK1P57059 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIK1P57059 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIK1P57059 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIK1P57059 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIK1P57059 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIK1P57059 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIK1P57059 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIK1P57059 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIK1P57059 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIK1P57059 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIK1P57059 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SIK1P57059 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIK1P57059 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms