Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSCP56915 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSCP56915 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSCP56915 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSCP56915 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSCP56915 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSCP56915 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSCP56915 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSCP56915 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSCP56915 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSCP56915 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GSCP56915 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSCP56915 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSCP56915 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSCP56915 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSCP56915 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSCP56915 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSCP56915 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSCP56915 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSCP56915 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GSCP56915 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSCP56915 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSCP56915 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSCP56915 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSCP56915 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSCP56915 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSCP56915 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSCP56915 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSCP56915 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GSCP56915 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSCP56915 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSCP56915 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSCP56915 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GSCP56915 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSCP56915 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSCP56915 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSCP56915 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSCP56915 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GSCP56915 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSCP56915 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSCP56915 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSCP56915 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSCP56915 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSCP56915 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSCP56915 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSCP56915 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSCP56915 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSCP56915 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSCP56915 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSCP56915 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSCP56915 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSCP56915 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSCP56915 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSCP56915 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSCP56915 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSCP56915 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSCP56915 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSCP56915 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSCP56915 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSCP56915 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GSCP56915 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GSCP56915 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GSCP56915 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GSCP56915 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GSCP56915 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GSCP56915 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GSCP56915 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GSCP56915 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GSCP56915 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GSCP56915 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GSCP56915 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GSCP56915 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GSCP56915 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GSCP56915 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GSCP56915 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GSCP56915 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GSCP56915 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GSCP56915 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GSCP56915 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GSCP56915 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GSCP56915 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GSCP56915 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GSCP56915 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GSCP56915 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GSCP56915 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GSCP56915 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GSCP56915 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GSCP56915 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GSCP56915 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GSCP56915 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GSCP56915 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GSCP56915 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GSCP56915 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GSCP56915 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GSCP56915 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GSCP56915 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GSCP56915 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GSCP56915 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GSCP56915 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GSCP56915 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms