Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YARSP54577 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YARSP54577 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YARSP54577 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
YARSP54577 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
YARSP54577 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YARSP54577 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YARSP54577 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YARSP54577 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YARSP54577 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YARSP54577 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
YARSP54577 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
YARSP54577 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YARSP54577 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YARSP54577 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
YARSP54577 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
YARSP54577 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
YARSP54577 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YARSP54577 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
YARSP54577 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YARSP54577 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YARSP54577 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
YARSP54577 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
YARSP54577 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YARSP54577 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YARSP54577 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YARSP54577 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YARSP54577 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YARSP54577 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YARSP54577 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YARSP54577 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YARSP54577 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YARSP54577 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YARSP54577 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YARSP54577 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YARSP54577 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YARSP54577 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YARSP54577 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YARSP54577 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YARSP54577 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YARSP54577 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YARSP54577 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YARSP54577 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YARSP54577 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YARSP54577 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YARSP54577 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YARSP54577 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YARSP54577 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YARSP54577 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YARSP54577 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YARSP54577 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YARSP54577 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
YARSP54577 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YARSP54577 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YARSP54577 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YARSP54577 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YARSP54577 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YARSP54577 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YARSP54577 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YARSP54577 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YARSP54577 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YARSP54577 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YARSP54577 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YARSP54577 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YARSP54577 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YARSP54577 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YARSP54577 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YARSP54577 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YARSP54577 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YARSP54577 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YARSP54577 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YARSP54577 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YARSP54577 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YARSP54577 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YARSP54577 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YARSP54577 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YARSP54577 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YARSP54577 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YARSP54577 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YARSP54577 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YARSP54577 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YARSP54577 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YARSP54577 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YARSP54577 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YARSP54577 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YARSP54577 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YARSP54577 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YARSP54577 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YARSP54577 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YARSP54577 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YARSP54577 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YARSP54577 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YARSP54577 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YARSP54577 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YARSP54577 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YARSP54577 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YARSP54577 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YARSP54577 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YARSP54577 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YARSP54577 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms