Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACLYP53396 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACLYP53396 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACLYP53396 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACLYP53396 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACLYP53396 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACLYP53396 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACLYP53396 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACLYP53396 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACLYP53396 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACLYP53396 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACLYP53396 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACLYP53396 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACLYP53396 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACLYP53396 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACLYP53396 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACLYP53396 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACLYP53396 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACLYP53396 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ACLYP53396 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACLYP53396 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACLYP53396 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACLYP53396 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACLYP53396 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACLYP53396 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACLYP53396 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACLYP53396 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACLYP53396 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACLYP53396 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACLYP53396 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACLYP53396 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACLYP53396 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACLYP53396 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACLYP53396 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACLYP53396 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACLYP53396 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACLYP53396 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACLYP53396 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACLYP53396 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACLYP53396 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACLYP53396 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACLYP53396 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACLYP53396 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACLYP53396 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACLYP53396 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACLYP53396 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACLYP53396 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ACLYP53396 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ACLYP53396 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACLYP53396 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACLYP53396 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACLYP53396 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACLYP53396 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACLYP53396 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACLYP53396 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ACLYP53396 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACLYP53396 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACLYP53396 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACLYP53396 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACLYP53396 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACLYP53396 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACLYP53396 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACLYP53396 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACLYP53396 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACLYP53396 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACLYP53396 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACLYP53396 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACLYP53396 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACLYP53396 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACLYP53396 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACLYP53396 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACLYP53396 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACLYP53396 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACLYP53396 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACLYP53396 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACLYP53396 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ACLYP53396 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACLYP53396 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACLYP53396 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACLYP53396 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACLYP53396 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACLYP53396 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACLYP53396 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACLYP53396 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACLYP53396 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACLYP53396 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACLYP53396 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ACLYP53396 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACLYP53396 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACLYP53396 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACLYP53396 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACLYP53396 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ACLYP53396 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACLYP53396 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACLYP53396 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACLYP53396 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACLYP53396 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACLYP53396 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACLYP53396 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACLYP53396 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms