Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP5P51878 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP5P51878 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP5P51878 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP5P51878 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP5P51878 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP5P51878 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP5P51878 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP5P51878 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP5P51878 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP5P51878 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP5P51878 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP5P51878 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP5P51878 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP5P51878 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP5P51878 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP5P51878 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP5P51878 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP5P51878 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP5P51878 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP5P51878 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP5P51878 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP5P51878 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP5P51878 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP5P51878 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP5P51878 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP5P51878 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP5P51878 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP5P51878 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP5P51878 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP5P51878 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP5P51878 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP5P51878 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP5P51878 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP5P51878 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP5P51878 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP5P51878 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP5P51878 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP5P51878 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP5P51878 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP5P51878 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP5P51878 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP5P51878 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP5P51878 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP5P51878 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP5P51878 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP5P51878 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP5P51878 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP5P51878 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP5P51878 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP5P51878 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP5P51878 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP5P51878 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP5P51878 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP5P51878 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP5P51878 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP5P51878 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP5P51878 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP5P51878 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP5P51878 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP5P51878 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP5P51878 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP5P51878 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP5P51878 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP5P51878 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP5P51878 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP5P51878 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP5P51878 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP5P51878 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP5P51878 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP5P51878 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP5P51878 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP5P51878 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP5P51878 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP5P51878 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP5P51878 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP5P51878 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP5P51878 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP5P51878 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP5P51878 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP5P51878 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP5P51878 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP5P51878 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP5P51878 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP5P51878 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP5P51878 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP5P51878 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP5P51878 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP5P51878 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP5P51878 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP5P51878 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP5P51878 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP5P51878 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP5P51878 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP5P51878 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP5P51878 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP5P51878 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP5P51878 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP5P51878 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP5P51878 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms