Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETV1P50549 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETV1P50549 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETV1P50549 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETV1P50549 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETV1P50549 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETV1P50549 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETV1P50549 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETV1P50549 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETV1P50549 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETV1P50549 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETV1P50549 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETV1P50549 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETV1P50549 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETV1P50549 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ETV1P50549 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETV1P50549 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETV1P50549 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETV1P50549 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETV1P50549 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETV1P50549 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ETV1P50549 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETV1P50549 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETV1P50549 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETV1P50549 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETV1P50549 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETV1P50549 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETV1P50549 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETV1P50549 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETV1P50549 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ETV1P50549 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETV1P50549 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETV1P50549 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETV1P50549 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETV1P50549 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETV1P50549 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETV1P50549 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETV1P50549 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETV1P50549 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETV1P50549 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETV1P50549 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETV1P50549 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETV1P50549 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ETV1P50549 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ETV1P50549 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ETV1P50549 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ETV1P50549 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ETV1P50549 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ETV1P50549 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ETV1P50549 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ETV1P50549 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ETV1P50549 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ETV1P50549 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ETV1P50549 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ETV1P50549 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ETV1P50549 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ETV1P50549 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ETV1P50549 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ETV1P50549 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ETV1P50549 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ETV1P50549 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV1P50549 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV1P50549 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV1P50549 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV1P50549 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV1P50549 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV1P50549 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV1P50549 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV1P50549 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV1P50549 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV1P50549 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV1P50549 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV1P50549 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV1P50549 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV1P50549 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV1P50549 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV1P50549 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV1P50549 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV1P50549 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV1P50549 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV1P50549 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV1P50549 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV1P50549 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV1P50549 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV1P50549 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV1P50549 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV1P50549 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV1P50549 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV1P50549 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV1P50549 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV1P50549 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV1P50549 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV1P50549 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV1P50549 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV1P50549 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV1P50549 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV1P50549 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV1P50549 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV1P50549 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV1P50549 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms