Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT6CP48668 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms