Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSG1P42857 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSG1P42857 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NSG1P42857 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSG1P42857 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSG1P42857 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSG1P42857 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSG1P42857 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSG1P42857 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSG1P42857 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSG1P42857 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSG1P42857 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NSG1P42857 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSG1P42857 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSG1P42857 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSG1P42857 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSG1P42857 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSG1P42857 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSG1P42857 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSG1P42857 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSG1P42857 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSG1P42857 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSG1P42857 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSG1P42857 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSG1P42857 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSG1P42857 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSG1P42857 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSG1P42857 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSG1P42857 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSG1P42857 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSG1P42857 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NSG1P42857 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NSG1P42857 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSG1P42857 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSG1P42857 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSG1P42857 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSG1P42857 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSG1P42857 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSG1P42857 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSG1P42857 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSG1P42857 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSG1P42857 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSG1P42857 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSG1P42857 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSG1P42857 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSG1P42857 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSG1P42857 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSG1P42857 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSG1P42857 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSG1P42857 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSG1P42857 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSG1P42857 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NSG1P42857 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSG1P42857 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSG1P42857 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSG1P42857 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSG1P42857 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSG1P42857 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSG1P42857 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSG1P42857 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSG1P42857 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSG1P42857 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSG1P42857 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSG1P42857 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSG1P42857 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSG1P42857 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSG1P42857 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NSG1P42857 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSG1P42857 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSG1P42857 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSG1P42857 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSG1P42857 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSG1P42857 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSG1P42857 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSG1P42857 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSG1P42857 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSG1P42857 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSG1P42857 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NSG1P42857 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSG1P42857 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSG1P42857 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NSG1P42857 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSG1P42857 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSG1P42857 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSG1P42857 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSG1P42857 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSG1P42857 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSG1P42857 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSG1P42857 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSG1P42857 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSG1P42857 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NSG1P42857 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSG1P42857 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSG1P42857 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSG1P42857 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSG1P42857 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSG1P42857 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSG1P42857 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSG1P42857 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSG1P42857 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms