Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms