Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms