Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP8P40818 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP8P40818 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP8P40818 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP8P40818 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP8P40818 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP8P40818 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP8P40818 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP8P40818 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP8P40818 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP8P40818 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP8P40818 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP8P40818 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP8P40818 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP8P40818 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP8P40818 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP8P40818 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP8P40818 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP8P40818 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP8P40818 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP8P40818 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP8P40818 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP8P40818 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP8P40818 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP8P40818 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP8P40818 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP8P40818 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP8P40818 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP8P40818 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP8P40818 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP8P40818 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP8P40818 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP8P40818 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
USP8P40818 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP8P40818 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP8P40818 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP8P40818 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP8P40818 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP8P40818 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP8P40818 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP8P40818 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP8P40818 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP8P40818 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP8P40818 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP8P40818 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP8P40818 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP8P40818 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP8P40818 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP8P40818 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP8P40818 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP8P40818 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP8P40818 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP8P40818 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP8P40818 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP8P40818 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP8P40818 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP8P40818 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP8P40818 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP8P40818 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP8P40818 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP8P40818 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP8P40818 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP8P40818 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP8P40818 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP8P40818 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP8P40818 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP8P40818 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP8P40818 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP8P40818 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP8P40818 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP8P40818 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP8P40818 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP8P40818 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP8P40818 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP8P40818 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP8P40818 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP8P40818 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP8P40818 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP8P40818 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP8P40818 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP8P40818 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP8P40818 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP8P40818 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP8P40818 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP8P40818 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP8P40818 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP8P40818 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP8P40818 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP8P40818 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP8P40818 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP8P40818 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP8P40818 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP8P40818 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP8P40818 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP8P40818 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP8P40818 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP8P40818 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP8P40818 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP8P40818 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP8P40818 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms