Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRLP40313 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRLP40313 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRLP40313 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRLP40313 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRLP40313 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRLP40313 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRLP40313 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRLP40313 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRLP40313 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRLP40313 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRLP40313 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRLP40313 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRLP40313 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRLP40313 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRLP40313 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRLP40313 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRLP40313 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRLP40313 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRLP40313 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRLP40313 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRLP40313 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRLP40313 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRLP40313 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRLP40313 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRLP40313 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRLP40313 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRLP40313 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRLP40313 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRLP40313 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRLP40313 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRLP40313 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRLP40313 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRLP40313 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRLP40313 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRLP40313 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRLP40313 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRLP40313 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRLP40313 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRLP40313 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRLP40313 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTRLP40313 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTRLP40313 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTRLP40313 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRLP40313 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRLP40313 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRLP40313 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRLP40313 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRLP40313 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRLP40313 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRLP40313 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRLP40313 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRLP40313 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRLP40313 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRLP40313 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRLP40313 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRLP40313 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRLP40313 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRLP40313 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRLP40313 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRLP40313 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRLP40313 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRLP40313 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRLP40313 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRLP40313 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRLP40313 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRLP40313 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRLP40313 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRLP40313 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRLP40313 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRLP40313 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRLP40313 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRLP40313 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRLP40313 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRLP40313 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRLP40313 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRLP40313 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRLP40313 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRLP40313 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRLP40313 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRLP40313 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRLP40313 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRLP40313 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRLP40313 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRLP40313 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRLP40313 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRLP40313 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRLP40313 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRLP40313 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRLP40313 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRLP40313 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRLP40313 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRLP40313 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRLP40313 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRLP40313 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRLP40313 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRLP40313 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRLP40313 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms