Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ETFBP38117 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ETFBP38117 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ETFBP38117 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ETFBP38117 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ETFBP38117 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ETFBP38117 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ETFBP38117 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ETFBP38117 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETFBP38117 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETFBP38117 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETFBP38117 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETFBP38117 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETFBP38117 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETFBP38117 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETFBP38117 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETFBP38117 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETFBP38117 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETFBP38117 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETFBP38117 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETFBP38117 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETFBP38117 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETFBP38117 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETFBP38117 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETFBP38117 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETFBP38117 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETFBP38117 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETFBP38117 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETFBP38117 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ETFBP38117 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETFBP38117 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ETFBP38117 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETFBP38117 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETFBP38117 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETFBP38117 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETFBP38117 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETFBP38117 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETFBP38117 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETFBP38117 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETFBP38117 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETFBP38117 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETFBP38117 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETFBP38117 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETFBP38117 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETFBP38117 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETFBP38117 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETFBP38117 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETFBP38117 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ETFBP38117 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETFBP38117 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETFBP38117 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ETFBP38117 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETFBP38117 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ETFBP38117 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETFBP38117 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ETFBP38117 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETFBP38117 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETFBP38117 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETFBP38117 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETFBP38117 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETFBP38117 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ETFBP38117 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETFBP38117 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETFBP38117 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETFBP38117 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETFBP38117 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETFBP38117 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETFBP38117 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETFBP38117 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETFBP38117 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ETFBP38117 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ETFBP38117 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ETFBP38117 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ETFBP38117 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ETFBP38117 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ETFBP38117 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ETFBP38117 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ETFBP38117 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ETFBP38117 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ETFBP38117 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ETFBP38117 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ETFBP38117 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ETFBP38117 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ETFBP38117 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ETFBP38117 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ETFBP38117 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ETFBP38117 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ETFBP38117 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ETFBP38117 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ETFBP38117 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ETFBP38117 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ETFBP38117 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ETFBP38117 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ETFBP38117 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ETFBP38117 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ETFBP38117 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ETFBP38117 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ETFBP38117 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ETFBP38117 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ETFBP38117 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms