Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNCAP37840 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNCAP37840 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNCAP37840 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNCAP37840 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNCAP37840 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNCAP37840 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNCAP37840 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNCAP37840 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNCAP37840 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNCAP37840 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNCAP37840 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNCAP37840 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNCAP37840 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNCAP37840 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNCAP37840 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNCAP37840 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNCAP37840 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNCAP37840 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNCAP37840 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNCAP37840 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNCAP37840 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNCAP37840 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNCAP37840 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNCAP37840 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNCAP37840 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNCAP37840 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNCAP37840 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNCAP37840 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNCAP37840 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNCAP37840 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNCAP37840 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNCAP37840 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNCAP37840 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNCAP37840 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SNCAP37840 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNCAP37840 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SNCAP37840 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNCAP37840 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNCAP37840 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNCAP37840 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNCAP37840 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNCAP37840 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNCAP37840 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNCAP37840 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNCAP37840 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNCAP37840 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNCAP37840 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNCAP37840 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNCAP37840 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNCAP37840 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNCAP37840 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNCAP37840 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNCAP37840 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNCAP37840 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNCAP37840 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNCAP37840 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNCAP37840 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNCAP37840 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNCAP37840 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNCAP37840 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SNCAP37840 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNCAP37840 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNCAP37840 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNCAP37840 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNCAP37840 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNCAP37840 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNCAP37840 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNCAP37840 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNCAP37840 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNCAP37840 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNCAP37840 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNCAP37840 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms