Protein–RNA interactions for Protein: P36873

PPP1CC, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-gamma catalytic subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CCP36873 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PPP1CCP36873 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PPP1CCP36873 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PPP1CCP36873 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PPP1CCP36873 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PPP1CCP36873 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PPP1CCP36873 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPP1CCP36873 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms