Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL4P36578 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL4P36578 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL4P36578 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL4P36578 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL4P36578 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL4P36578 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL4P36578 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL4P36578 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL4P36578 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL4P36578 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL4P36578 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL4P36578 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL4P36578 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL4P36578 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL4P36578 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL4P36578 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL4P36578 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL4P36578 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL4P36578 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL4P36578 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL4P36578 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL4P36578 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL4P36578 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL4P36578 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL4P36578 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL4P36578 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL4P36578 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL4P36578 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL4P36578 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL4P36578 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL4P36578 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL4P36578 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL4P36578 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL4P36578 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL4P36578 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL4P36578 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL4P36578 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL4P36578 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL4P36578 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL4P36578 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL4P36578 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL4P36578 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL4P36578 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL4P36578 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL4P36578 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL4P36578 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL4P36578 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL4P36578 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL4P36578 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL4P36578 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL4P36578 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL4P36578 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL4P36578 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL4P36578 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL4P36578 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL4P36578 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL4P36578 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL4P36578 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL4P36578 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL4P36578 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL4P36578 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL4P36578 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL4P36578 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL4P36578 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL4P36578 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL4P36578 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL4P36578 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL4P36578 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL4P36578 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL4P36578 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL4P36578 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL4P36578 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL4P36578 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL4P36578 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL4P36578 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL4P36578 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL4P36578 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL4P36578 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL4P36578 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL4P36578 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL4P36578 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL4P36578 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL4P36578 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL4P36578 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL4P36578 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL4P36578 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL4P36578 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL4P36578 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL4P36578 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL4P36578 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL4P36578 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL4P36578 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL4P36578 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL4P36578 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL4P36578 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL4P36578 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL4P36578 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL4P36578 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL4P36578 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms