Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJC1P36383 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJC1P36383 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJC1P36383 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJC1P36383 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJC1P36383 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJC1P36383 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJC1P36383 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJC1P36383 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJC1P36383 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJC1P36383 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJC1P36383 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJC1P36383 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJC1P36383 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJC1P36383 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJC1P36383 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJC1P36383 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJC1P36383 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJC1P36383 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJC1P36383 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJC1P36383 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJC1P36383 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJC1P36383 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJC1P36383 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJC1P36383 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJC1P36383 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJC1P36383 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJC1P36383 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GJC1P36383 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJC1P36383 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJC1P36383 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJC1P36383 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJC1P36383 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJC1P36383 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJC1P36383 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJC1P36383 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJC1P36383 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJC1P36383 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJC1P36383 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJC1P36383 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJC1P36383 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJC1P36383 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJC1P36383 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJC1P36383 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJC1P36383 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJC1P36383 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJC1P36383 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJC1P36383 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJC1P36383 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJC1P36383 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJC1P36383 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJC1P36383 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJC1P36383 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJC1P36383 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJC1P36383 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJC1P36383 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GJC1P36383 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJC1P36383 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJC1P36383 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJC1P36383 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJC1P36383 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJC1P36383 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJC1P36383 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJC1P36383 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJC1P36383 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJC1P36383 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJC1P36383 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJC1P36383 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJC1P36383 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJC1P36383 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJC1P36383 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJC1P36383 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJC1P36383 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJC1P36383 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJC1P36383 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJC1P36383 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GJC1P36383 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJC1P36383 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJC1P36383 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJC1P36383 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJC1P36383 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJC1P36383 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJC1P36383 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJC1P36383 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJC1P36383 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJC1P36383 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJC1P36383 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJC1P36383 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJC1P36383 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJC1P36383 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJC1P36383 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJC1P36383 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJC1P36383 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GJC1P36383 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJC1P36383 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJC1P36383 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJC1P36383 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJC1P36383 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJC1P36383 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJC1P36383 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms