Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA4P35212 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA4P35212 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA4P35212 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA4P35212 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA4P35212 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA4P35212 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA4P35212 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA4P35212 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA4P35212 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA4P35212 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA4P35212 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA4P35212 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA4P35212 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA4P35212 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA4P35212 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA4P35212 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA4P35212 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA4P35212 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA4P35212 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA4P35212 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA4P35212 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA4P35212 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA4P35212 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA4P35212 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA4P35212 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA4P35212 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA4P35212 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA4P35212 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA4P35212 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA4P35212 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA4P35212 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA4P35212 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA4P35212 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA4P35212 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA4P35212 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA4P35212 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA4P35212 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA4P35212 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA4P35212 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA4P35212 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA4P35212 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA4P35212 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA4P35212 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA4P35212 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA4P35212 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA4P35212 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA4P35212 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA4P35212 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA4P35212 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA4P35212 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA4P35212 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA4P35212 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA4P35212 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA4P35212 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA4P35212 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA4P35212 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA4P35212 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA4P35212 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA4P35212 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA4P35212 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA4P35212 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA4P35212 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA4P35212 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA4P35212 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA4P35212 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA4P35212 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA4P35212 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA4P35212 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA4P35212 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA4P35212 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA4P35212 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA4P35212 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA4P35212 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA4P35212 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA4P35212 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA4P35212 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA4P35212 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA4P35212 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA4P35212 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA4P35212 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA4P35212 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA4P35212 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA4P35212 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA4P35212 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA4P35212 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA4P35212 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA4P35212 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA4P35212 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA4P35212 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA4P35212 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA4P35212 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA4P35212 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA4P35212 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA4P35212 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA4P35212 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA4P35212 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA4P35212 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA4P35212 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA4P35212 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms